Микробиология
Возбудители инфекций: морфология, дискриминаторы, вирулентность и клиника — различение похожих микроорганизмов.
Грамположительные бактерии
Грамположительные неспорообразующие палочки
Listeria, Erysipelothrix, Corynebacterium diphtheriae, Gardnerella vaginalis — морфология, патогенез, клинические синдромы.
Грамположительные спорообразующие палочки
Bacillus anthracis и Bacillus cereus — морфология, токсины, клинические формы и дифференциация.
Грамположительные кокки
Различение Gram(+) кокков: стафилококки, стрептококки, энтерококки — морфология, дискриминаторы и дихотомический ключ.
Грамотрицательные бактерии
Грамотрицательные кокки: Neisseria и HACEK
Neisseria gonorrhoeae, N. meningitidis, Kingella kingae, Eikenella corrodens — морфология, дискриминаторы, ключевые клинические синдромы.
Грамотрицательные изогнутые палочки
Vibrio cholerae, Campylobacter jejuni, Helicobacter pylori — оксидаза-положительные изогнутые/спиральные палочки: запятая vs S-форма vs спираль, уреаза как ключевой различитель (Helicobacter+), синдромы — холера, энтероколит, гастрит/язва.
Грамотрицательные палочки: Enterobacterales
E. coli, Shigella, Salmonella enterica — дискриминаторы, патогенез кишечных инфекций, основные клинические синдромы.
Грамотрицательные палочки: не-Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa, Bordetella pertussis, Haemophilus influenzae, Legionella pneumophila — оксидаза-положительные неферментирующие и прихотливые палочки, их дискриминаторы и ключевые синдромы.
Грамотрицательные зоонозные палочки
Brucella, Bartonella, Francisella — мелкие грамотрицательные факультативно внутриклеточные палочки/коккобактерии зоонозов: бруцеллёз, болезнь кошачьих царапин/окопная лихорадка, туляремия.
Кислотоустойчивые
Грибы
Патогенные грибы
Aspergillus, Mucor, Pneumocystis jirovecii — морфология, инвазивный потенциал, клинические формы микозов у иммунокомпрометированных.
Грибы: поверхностные и дерматофиты
Malassezia, Hortaea, Piedraia, Trichosporon и дерматофиты (Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton) — возбудители поверхностных и кожных микозов: разноцветный лишай, чёрная пьедра, дерматофитии (tinea).
Грибы: системные и диморфные
Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides, Paracoccidioides, Talaromyces, Cryptococcus и Candida — возбудители системных микозов: диморфизм, эндемичность, первичный лёгочный очаг с диссеминацией и оппортунистический кандидоз.
Простейшие
Вирусы
ДНК-вирусы
Различение ДНК-вирусов: семейство Herpesviridae (ВПГ-1, ВПГ-2, VZV, EBV, CMV) — структура, латентность и переход от лабораторной к клинической оси различения.
ДНК-вирусы: прочие
Аденовирус, ВПЧ (папиллома) и вирус гепатита B (гепадна, ДНК-ОТ) — ДНК-вирусы вне семейства Herpesviridae: безоболочечные vs оболочечные, дискриминаторы и ключевые синдромы.
РНК-вирусы: кишечные
Полиовирус, Коксаки, ECHO, вирус гепатита A (пикорнавирусы) и ротавирус — безоболочечные кишечные вирусы фекально-орального пути: дискриминаторы, патогенез и ключевые синдромы.
РНК-вирусы: респираторные
Риновирус, вирусы гриппа A/B (ортомиксо), парагрипп/паротит/корь (парамиксо) и RSV — респираторные РНК-вирусы воздушно-капельного пути: дискриминаторы, патогенез и ключевые синдромы.
РНК-вирусы: системные
ВИЧ (ретро), HCV/денге/жёлтая лихорадка (флави), краснуха (тога), SARS-CoV (корона), бешенство (рабдо) и HDV — системные и трансмиссивные РНК-вирусы: дискриминаторы, патогенез и ключевые синдромы.
Другое
Анаэробы (не-клостридиальные)
Bacteroides fragilis, Fusobacterium, Actinomyces, Cutibacterium и пигментные оральные анаэробы — облигатные анаэробы вне рода Clostridium: грам-различение, абсцессы и оппортунистические инфекции. Клостридии — в топике спорообразующих Г+ палочек.
Атипичные бактерии
Mycoplasma, Chlamydia, Rickettsia, Coxiella — бактерии без классической клеточной стенки или облигатные внутриклеточные: не окрашиваются по Граму, дискриминаторы по биологии и переносчику, ключевые синдромы (атипичная пневмония, ИППП, сыпной тиф, Q-лихорадка).
Спирохеты
Treponema pallidum, Borrelia (burgdorferi, recurrentis), Leptospira interrogans — спиральные подвижные бактерии: число завитков, путь передачи, стадийность и ключевые синдромы (сифилис, болезнь Лайма, лептоспироз).